[Perl] Re: bioperl

[Mauricio Herrera Cuadra]

Ampliando lo antes mencionado por Gunnar, echale una leida a este link,
ahi esta todo lo que necesitas si lo vas a utilizar en windows:

http://www.bioperl.org/Core/Latest/INSTALL.WIN

De cualquier forma, apoyo la sugerencia de Gunnar sobre utilizar una
plataforma tipo unix (*BSD o Linux), debido a que existen varios programas
en unix que se pueden utilizar como un complemento para BioPerl, tales
como:

- clustalw
- t_coffee
- BLAST
- EMBOSS, entre otros.

Tambien te recomiendo que antes de instalar BioPerl por medio del PPM de
ActiveState, instales un modulo llamado Bundle::BioPerl el cual instala
modulos ajenos a BioPerl, pero que se utilizan para multiples tareas
realizadas por el mismo, tales como:

- HTTP::Request::Common
- LWP::UserAgent
- AcePerl
- IO::String
- XML::Parser
- XML::Writer
- XML::Parser::PerlSAX
- XML::Twig
- File::Temp
- SOAP::Lite
- HTML::Parser
- DBD::mysql
- GD
- srsperl
- Storable
- Text::Shellwords
- XML::DOM
- DB_File
- Graph::Directed
- Data::Stag::ITextWriter
- Data::Stag::SxprWriter
- Data::Stag::XMLWriter

Si deseas saber el papel de estos modulos dentro de BioPerl, echale un ojo
al final del siguiente documento:

http://bioperl.org/Core/Latest/INSTALL

No recuerdo si Bundle::BioPerl existe dentro de PPM, pero de no ser asi,
lo puedes instalar por medio del modulo CPAN.

Toda esta informacion ampliada y explicada + o - coherentemente se
encuentra en las 2 ligas mencionadas.

Espero que te sea de ayuda.
Saludos :)

> Date: Fri, 16 May 2003 22:25:40 -0500
> From: Gunnar Wolf <gwolf@gwolf.cx>
> To: paula <paul@mail2.udc.es>
> Cc: perl@tlali.iztacala.unam.mx
> Subject: Re: [Perl] RE: Perl digest, Vol 1 #301 - 1 msg
> 
> paula dijo [Thu, May 15, 2003 at 04:47:25PM +0200]:
> > De momento tengo el Windows 98, pero podria instalarlo en windows 2000
> nt o
> > windows xp.
> > de lo que no tengo ni idea es de linux, y tp tengo posibilidad de
> instalarlo
> 
> Entoncers asómate a ActiveState - http://activestate.com/ - Ahí podrás
> bajarlo.
> 
> Perl es excelente cuando piensas en la multiplataforma - cualquier
> desarrollo que hagas en Unix va a correr en Windows (a menos que uses
> los componentes específicos a uno u otro lado, claro ;-) ). Eso sí, no
> puedo no recomendarte instalar un sistema Linux o cualquier otro entorno
> tipo Unix - te presentan un entorno mucho más completo y amigable al
> programador.
> 
> Saludos,
> 
> -- 
> Gunnar Wolf - gwolf@gwolf.cx - (+52-55)5630-9700 ext. 1366
> PGP key 1024D/8BB527AF 2001-10-23
> Fingerprint: 0C79 D2D1 2C4E 9CE4 5973  F800 D80E F35A 8BB5 27AF

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MAURICIO HERRERA CUADRA
arareko@yahoo.com
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